究所、上海細(xì)胞生物學(xué)研究所、上海生理研究所、上海腦研究所、上海藥物研究所、上海植物生理研究所、上海昆蟲研究所和上海生物工程研究中心等8個(gè)生命科學(xué)研究機(jī)構(gòu)經(jīng)過結(jié)構(gòu)調(diào)整、體制創(chuàng)新而組建成的。現(xiàn)有8個(gè)研究所和3個(gè)支撐單元，分別是生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所、神經(jīng)科學(xué)研究所、藥物研究所、植物生理生態(tài)研究所、健康科學(xué)研究所、營養(yǎng)科學(xué)研究所、上海巴斯德研究所和中科院－馬普計(jì)算生物學(xué)伙伴研究所，以及上海生命科學(xué)信息中心、上海中科伍佰豪生物工程研究發(fā)展有限公司、上海實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心。

　　上海生科院的重點(diǎn)研究領(lǐng)域主要有：功能基因組、蛋白質(zhì)組和生物信息學(xué)，生物大分子的結(jié)構(gòu)、相互作用及功能，細(xì)胞活動(dòng)的分子網(wǎng)絡(luò)調(diào)控，腦發(fā)育與腦功能的分子與細(xì)胞機(jī)制研究，防治重要疾病的新藥研究開發(fā)、中藥現(xiàn)代化研究以及藥物研究的理論和方法，植物分子生理和植物與環(huán)境的相互作用，生物技術(shù)的創(chuàng)新和應(yīng)用，生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化型研究，現(xiàn)代營養(yǎng)科學(xué)研究，病毒學(xué)與免疫學(xué)研究，計(jì)算生物學(xué)研究，以及生命科學(xué)與其他學(xué)科的交叉研究。 上海生科院根據(jù)國家重大戰(zhàn)略需求和世界科技發(fā)展前沿，圍繞建設(shè)以人口健康與醫(yī)藥為主線的生命科學(xué)創(chuàng)新基地的戰(zhàn)略目標(biāo)，將科技創(chuàng)新活動(dòng)聚焦于生命現(xiàn)象本質(zhì)的前沿探索和基礎(chǔ)研究，人口健康重大問題的轉(zhuǎn)化型研究，生物資源、農(nóng)業(yè)和環(huán)境的關(guān)鍵問題等三大方向，努力在蛋白質(zhì)科學(xué)和表觀遺傳調(diào)控研究、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和細(xì)胞活動(dòng)分子網(wǎng)絡(luò)研究、腦與認(rèn)知、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、創(chuàng)新藥物、干細(xì)胞、腫瘤、糖尿病機(jī)理、營養(yǎng)與代謝、傳染性疾病、生物質(zhì)能源、轉(zhuǎn)基因作物等研究中作出重大原始創(chuàng)新的工作。上海生科院是在建的蛋白質(zhì)科學(xué)研究南方設(shè)施項(xiàng)目法人單位。蛋白質(zhì)科學(xué)研究南方設(shè)施的建立將提升我國生物技術(shù)高科技公司的核心競爭力，為我國打造出一個(gè)具有重大影響的*綜合性生命科學(xué)研究中心，使蛋白質(zhì)科學(xué)成為創(chuàng)新型國家的重要標(biāo)志；并帶動(dòng)生命科學(xué)的整體發(fā)展和醫(yī)藥、農(nóng)業(yè)、工業(yè)、環(huán)境等方面的生物技術(shù)進(jìn)入先進(jìn)行列。

　　承擔(dān)國家任務(wù)

　　上海生科院積極承擔(dān)國家和地方重大科研任務(wù)，共爭取到國家與地方各類科研項(xiàng)目（不含藥物所，以下同）989項(xiàng)。至2008年，共新增主持973項(xiàng)目7項(xiàng)、重大科學(xué)研究計(jì)劃項(xiàng)目11項(xiàng)、國家重大專項(xiàng)6項(xiàng)；新增主持863課題111項(xiàng)；新增國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目34項(xiàng)、重大研究計(jì)劃23項(xiàng)、杰出青年基金項(xiàng)目29項(xiàng)，創(chuàng)新群體7項(xiàng)；新增中科院創(chuàng)新重大項(xiàng)目2項(xiàng)，重要方向性項(xiàng)目87項(xiàng)；新增上海市各類項(xiàng)目284項(xiàng)。

　　重要成果　　

上海生科院在以下領(lǐng)域取得了一批重大成果。

　　神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域：在腦發(fā)育研究中發(fā)現(xiàn)了一系列調(diào)控神經(jīng)生長錐轉(zhuǎn)向生長和神經(jīng)細(xì)胞定向遷移的機(jī)制；在學(xué)習(xí)與記憶研究中發(fā)現(xiàn)果蠅跨模態(tài)學(xué)習(xí)的相互協(xié)同作用，以及果蠅蘑菇體和多巴胺系統(tǒng)共同掌控基于價(jià)值的抉擇；發(fā)現(xiàn)表達(dá)NG2膠質(zhì)細(xì)胞的突觸可塑性；在神經(jīng)系統(tǒng)疾病機(jī)理研究中發(fā)現(xiàn)β2-腎上腺素受體激活與老年癡呆癥的相關(guān)性，發(fā)現(xiàn)調(diào)控阿片受體分布及鎮(zhèn)痛功能的機(jī)理；等。相關(guān)成果發(fā)表于《Science》、《Nature》、《Cell》等雜志。

　　細(xì)胞信號傳導(dǎo)領(lǐng)域：在GPCR信號通路、Wnt信號通路、NF-κB信號通路、ERK信號通路的分子調(diào)控等方面取得大量研究成果。發(fā)現(xiàn)E2F6在紫外誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡中的作用及相關(guān)機(jī)制；發(fā)現(xiàn)新的ERK信號通路調(diào)控蛋白R(shí)KTG；發(fā)現(xiàn)β-arrestin調(diào)控Toll樣受體-白介素1體的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)；發(fā)現(xiàn)β-arrestin1調(diào)節(jié)組蛋白乙?；盎蜣D(zhuǎn)錄的核內(nèi)功能；等。相關(guān)成果發(fā)表于《Nature》系列、《Cell》及其系列等雜志。

　　表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域：在這個(gè)新興的前沿研究領(lǐng)域取得了快速并重要的進(jìn)展。發(fā)現(xiàn)染色質(zhì)組蛋白H3K79甲基化的調(diào)控機(jī)制和在白血病發(fā)生中的作用；發(fā)現(xiàn)WOR1的雙穩(wěn)態(tài)表達(dá)主控白念珠菌的白－灰形態(tài)轉(zhuǎn)換；發(fā)現(xiàn)YL1蛋白N-端dsRBD結(jié)構(gòu)域?qū)iRNA前體加工；發(fā)現(xiàn)新表觀遺傳控制基因；等。相關(guān)成果發(fā)表于《Cell》及其系列、《PNAS》等雜志。

　　植物分子遺傳學(xué)領(lǐng)域：在水稻基因組和植物功能基因組、植物的重要生理過程研究包括生殖發(fā)育、植物激素作用、代謝調(diào)控等分子機(jī)理方面以及在植物表觀遺傳學(xué)、信號傳導(dǎo)以及昆蟲功能基因組學(xué)、昆蟲與植物的互作等前沿領(lǐng)域取得了重要進(jìn)展。相關(guān)成果發(fā)表于《Nature》系列、《Plant Cell》、《PNAS》等雜志。

　　腫瘤相關(guān)機(jī)理領(lǐng)域：在對部分腫瘤的發(fā)病機(jī)理、治療機(jī)理以及新靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)等研究中取得了重要進(jìn)展。發(fā)現(xiàn)一種新的白血病腫瘤抑制基因失活的分子遺傳學(xué)機(jī)制；發(fā)現(xiàn)新喜樹堿衍生物NSC606985通過依賴PKC-δ的機(jī)制在納摩爾濃度誘導(dǎo)白血病細(xì)胞凋亡；發(fā)現(xiàn)磷脂酰融合酶在白血病細(xì)胞分化中起重要作用；等。相關(guān)成果發(fā)表于《Nature》系列、《Blood》等雜志。

　　免疫學(xué)研究領(lǐng)域：在解決免疫學(xué)基礎(chǔ)科學(xué)問題、改善臨床診斷治療技術(shù)和技術(shù)轉(zhuǎn)化方面都取得了重要進(jìn)展，在同行中產(chǎn)生了重要影響。發(fā)現(xiàn)生物體內(nèi)調(diào)節(jié)CD4+ T細(xì)胞存活和自身免疫的新機(jī)制；發(fā)現(xiàn)生物體內(nèi)調(diào)節(jié)NK細(xì)胞殺傷活性和病毒免疫的新機(jī)制；發(fā)現(xiàn)生物體內(nèi)調(diào)節(jié)炎癥反應(yīng)的新機(jī)制；等。相關(guān)成果發(fā)表于《Nature》系列、《Blood》、《PNAS》等雜志。

　　干細(xì)胞研究領(lǐng)域：在胚胎干細(xì)胞自我更新和定向分化的分子研究領(lǐng)域取得顯著成績。建立了人的胚胎干細(xì)胞系并實(shí)現(xiàn)無滋養(yǎng)層培養(yǎng)，實(shí)現(xiàn)人胚胎干細(xì)胞向神經(jīng)細(xì)胞的定向誘導(dǎo)分化；發(fā)現(xiàn)對胚胎干細(xì)胞重要轉(zhuǎn)錄因子Oct4蛋白質(zhì)的新的修飾方式；發(fā)現(xiàn)胚胎發(fā)育早期神經(jīng)干細(xì)胞維持新機(jī)制；等。相關(guān)成果發(fā)表于《Cell》系列等雜志。

　　代謝疾病領(lǐng)域：在導(dǎo)致我國肥胖、代謝綜合癥、2型糖尿病等代謝性疾病的遺傳、環(huán)境因素及其調(diào)控機(jī)理等研究中取得重要進(jìn)展。發(fā)現(xiàn)Ufd1參與膽固醇合成調(diào)控的新機(jī)制；發(fā)現(xiàn)SIRT1調(diào)控胰島素敏感性；發(fā)現(xiàn)與糖尿病相關(guān)的葡萄糖激酶構(gòu)象變化機(jī)理；等。相關(guān)成果發(fā)表于《Cell》系列、《PNAS》等雜志。

　　發(fā)表高水平論文情況

　　至2008年，上海生科院獲國家科技獎(jiǎng)勵(lì)10項(xiàng)、地方科技獎(jiǎng)勵(lì)53項(xiàng)、*科技獎(jiǎng)2項(xiàng)。

　　2001年，生化與細(xì)胞所王恩多、王應(yīng)睞、李勇、李彤、黃意巍等人完成的“氨基酰-tRNA合成酶及其與相關(guān)tRNA的相互作用”獲國家自然科學(xué)獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)。

　　2002年，生化與細(xì)胞所甘人寶、李載平、黃培勇、張倩、錢悅等人完成的“重組人表皮生長因子研制及臨床應(yīng)用”獲國家科技進(jìn)步獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)。

　　2005年，生化與細(xì)胞所劉望夷、張勁松、劉仁水、何文君、凌俊等人完成的“核糖體失活蛋白與核糖體RNA結(jié)構(gòu)與功能的研究”獲國家自然科學(xué)獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)。

　　2007年，生化與細(xì)胞所裴鋼、高華、程智潔、荊清等人完成的“G蛋白偶聯(lián)受體信號與其它細(xì)胞信號通路間的對話機(jī)制”獲國家自然科學(xué)獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)。

　　2007年，植生生態(tài)所韓斌、馮旗、張玉軍等人完成的“水稻第四號染色體測序及功能分析”獲國家自然科學(xué)獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)。

　　2008年，生化與細(xì)胞所張永蓮、陳小章、劉強(qiáng)、胡遠(yuǎn)新、李鵬等人完成的“精子在附睪中成熟的分子基礎(chǔ)研究”獲國家自然科學(xué)獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)

　　知識(shí)產(chǎn)權(quán)與成果轉(zhuǎn)讓

　　至2008年，上海生科院共申請發(fā)明539項(xiàng)，其中和外國申請57項(xiàng)；授權(quán)發(fā)明197項(xiàng)，其中外國7項(xiàng)；獲新藥證書7項(xiàng)，國家新藥臨床批件5項(xiàng)（生物制品*類）。

　　一批技術(shù)向國內(nèi)外公司轉(zhuǎn)讓，包括基因工程酶法合成D-對羥基苯甘氨酸鄧鉀鹽技術(shù)及2項(xiàng)有關(guān)、高丁醇比例的微生物發(fā)酵法生產(chǎn)丁醇丙酮技術(shù)、“T細(xì)胞疫苗治療類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎疾病”相關(guān)技術(shù)、與中科院上海有機(jī)化學(xué)研究所共同發(fā)明的抗艾滋病候選藥物分子（“尼非韋羅”）、人胚胎干細(xì)胞系和小鼠胚胎干細(xì)胞系技術(shù)、治療實(shí)驗(yàn)性自身免疫性腦脊髓炎的兩個(gè)化合物等。